Anja van Dooren studeerde klarinet aan de conservatoria van Utrecht en Den Haag bij respectievelijk Bas de Jong (Docerend Musicus) en Harmen de Boer (Uitvoerend Musicus). Zij behaalde haar diploma`s in 1991 en 1994. 

Zij volgde masterclasses bij Karl Leister, Hans Deinzer en Anthony Pay in Duitsland en Italië.  

Naast het remplaceren bij diverse beroepsorkesten maakt zij veel kamermuziek, o.a. met het ensemble Contours, het Rossignol kwartet (fluit, hobo, klarinet, fagot) en het Duo Modern. Met het Duo Modern (fluit en klarinet) maakte zij in 2003 een CD. Naar aanleiding hiervan trad zij op in het concertgebouw te Amsterdam. Als soliste trad zij ook diverse keren met orkest op in het klarinetconcert van W.A.Mozart. 

Als klarinetdocente is Anja verbonden aan de streekmuziekschool te Leiden en aan muziekschool Fluxus te Zaandam.